SYBR Green I：這是一種較為常用的核酸染料，屬于花箐類染料。它能與雙鏈 DNA（dsDNA）小溝結合，結合后熒光信號會顯著增強，靈敏度較高，可檢測到低至皮克級的 dsDNA 。SYBR Green I 適用于實時熒光定量 PCR（qPCR），在 PCR 反應過程中，它會隨著雙鏈 DNA 的合成不斷嵌入，通過檢測熒光強度變化，實時監測 PCR 進程。不過，SYBR Green I 也存在一定局限性，它不僅能與 dsDNA 結合，還會與單鏈 DNA（ssDNA）、RNA 發生非特異性結合，可能產生較高的背景信號，影響實驗結果的準確性，因此在使用時需注意優化實驗條件 。

GoldView：是一種可替代 EB 的核酸染料，分為 GoldView I 和 GoldView II 。GoldView I 適用于瓊脂糖凝膠電泳染色，其靈敏度與 EB 相當，能清晰顯示核酸條帶。與 EB 相比，GoldView 的細胞毒性較低，對實驗人員和環境相對友好。它在紫外光激發下可發出綠色熒光，操作較為簡便。但 GoldView 的穩定性相對較差，長時間儲存可能會影響染色效果，且在某些實驗條件下，其熒光強度可能不如一些新型核酸染料 。

GelRed 和 GelGreen：這兩種染料均為花箐類二聚體核酸染料，具有高靈敏度、低毒性的特點。GelRed 專用于 dsDNA 染色，GelGreen 則可用于 dsDNA、ssDNA 和 RNA 染色 。它們的分子結構使其能夠緊密結合核酸，染色后條帶清晰，背景信號低，尤其適用于高分辨率瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳。此外，GelRed 和 GelGreen 可被標準的紫外凝膠成像系統和藍光透射儀激發，使用方便，且在實驗過程中對核酸遷移的影響較小，能準確反映核酸片段的大小 。

SYBR Safe：是一種安全型核酸染料，常用于瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳染色。它的化學穩定性高，與多種電泳緩沖液兼容 。SYBR Safe 對細胞的毒性較低，且致突變性極弱，在保障實驗人員安全方面表現良好。該染料靈敏度高，能檢測到微量核酸，并且與核酸結合后，在藍光或紫外光激發下可產生強熒光信號，適用于從核酸分離到回收的多種實驗流程 。不過，SYBR Safe 在 qPCR 中的應用相對較少，主要還是集中在凝膠電泳檢測領域 。